{"id":21515,"date":"2021-05-30T20:52:39","date_gmt":"2021-05-30T23:52:39","guid":{"rendered":"https:\/\/infovera.com.ar\/web\/?p=21515"},"modified":"2021-05-30T20:52:39","modified_gmt":"2021-05-30T23:52:39","slug":"efecto-vera-secuenciacion-palabra-clave-para-detectar-las-variantes-del-sars-cov-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/infovera.com.ar\/web\/2021\/05\/30\/efecto-vera-secuenciacion-palabra-clave-para-detectar-las-variantes-del-sars-cov-2\/","title":{"rendered":"“Efecto Vera”: secuenciaci\u00f3n, palabra clave para detectar las variantes del Sars-Cov-2"},"content":{"rendered":"

El organismo de referencia a nivel nacional es el Instituto Malbr\u00e1n, pero a trav\u00e9s del Proyecto PAIS se desarrolla en nodos de distintas provincias, tambi\u00e9n en Santa Fe.<\/strong><\/p>\n

La novedad de que la variante brit\u00e1nica del Sars Cov-2 est\u00e1 circulando en Vera, en el norte de la provincia, puso en alerta a la regi\u00f3n pero tambi\u00e9n trajo a un primer plano al procedimiento que se realiza para establecer qu\u00e9 variantes del virus que producen la Covid-19 est\u00e1n presentes en el territorio.<\/p>\n

La tecnolog\u00eda que permite definir si hay nuevas variantes de un virus es la secuenciaci\u00f3n gen\u00f3mica. El centro de referencia de todo el pa\u00eds para realizar ese estudio es el Instituto Malbr\u00e1n. Pero el Proyecto Argentino Interinstitucional de gen\u00f3mica de SARS Cov-2 (Proyecto Pa\u00eds) habilit\u00f3 a otros organismos a realizar esa investigaci\u00f3n: por Santa Fe participa el Laboratorio Central, para el centro y norte, y el Cemar para el sur.<\/p>\n

“Tenemos dos destinos donde enviar muestras para vigilancia de variantes en circulaci\u00f3n: uno es el Instituto Nacional de referencia, el Malbr\u00e1n, y el otro es el Inta de Rafaela en el marco del Proyecto Pa\u00eds del que formamos parte”, explica Viviana Mugna, bioqu\u00edmica integrante del Laboratorio.<\/p>\n

Eso si; no todas las muestras son destinadas al proceso de secuenciaci\u00f3n, “sino aquellas que re\u00fanen determinadas caracter\u00edsticas; a partir de all\u00ed se hace una vigilancia para saber qu\u00e9 variante est\u00e1 circulando”.<\/p>\n

“Todos esos datos integrados contribuyen a la vigilancia de las variantes que circulan en nuestra provincia”, aport\u00f3. Hasta el momento se sabe que est\u00e1n presentes las conocidas como Manaos y la brit\u00e1nica. A esa conclusi\u00f3n se llega a partir del proceso de secuenciaci\u00f3n cuyas conclusiones se cargan en el Sistema Integrado de Informaci\u00f3n Sanitaria Argentino (Sisa) donde se unifican los datos de todo el pa\u00eds.<\/p>\n

Como se dijo, no se estudian todas las muestras; “se hace una selecci\u00f3n de casos especiales que cumplan con determinados especiales y, por otro lado, se hace vigilancia regular de unos pocos lugares de la provincia para saber qu\u00e9 variante est\u00e1 circulando”.<\/p>\n

\u00bfPor qu\u00e9 se articula con el Inta Rafaela?<\/strong> “Porque tiene la capacidad en cuanto a equipamiento y personal id\u00f3neo para realizar la secuenciaci\u00f3n”, se\u00f1al\u00f3 Mugna.<\/p>\n

Desde marzo de 2020, el Laboratorio Central es una de las fuentes que permiten medir el pulso de la pandemia por el nuevo coronavirus. “Tambi\u00e9n desde antes como laboratorio de referencia desde la instrumentaci\u00f3n del diagn\u00f3stico molecular”, aporta su director, Carlos Pastor.<\/p>\n

La capacidad diagn\u00f3stica aument\u00f3 durante el a\u00f1o pasado y “todo lo que se recibe (las muestras), se procesan y resuelven en 24 horas”. “El a\u00f1o pasado fue de aprendizaje y ahora nos permite sobrellevar esta etapa un poco mejor”, aport\u00f3.<\/p>\n

Proyecto PAIS<\/strong><\/p>\n

Creado desde el Ministerio de Ciencia, Tecnolog\u00eda e Innovaci\u00f3n de la Naci\u00f3n, el Consorcio interinstitucional para la Secuenciaci\u00f3n del genoma y estudios gen\u00f3micos de SARS-CoV-2 est\u00e1 conformado por grupos de investigaci\u00f3n de diferentes instituciones con el objetivo de secuenciar el genoma y realizar dem\u00e1s estudios gen\u00f3micos del SARS-CoV-2.<\/p>\n

Tal como se indica en la p\u00e1gina oficial Argentina.gob.ar, el equipo est\u00e1 coordinado por la Dra. Mariana Viegas del Laboratorio de Virolog\u00eda Hospital de Ni\u00f1os Ricardo Guti\u00e9rrez y trabaja articulada y colaborativamente para realizar estudios gen\u00f3micos de SARS-CoV-2 en nuestro pa\u00eds y aportar tanto al conocimiento local como a la base de datos global de circulaci\u00f3n viral GISAID (Global Initiative on Sharing All Influenza Data). Entre sus objetivos se encuentran la secuenciaci\u00f3n de los genomas circulantes de SARS-CoV-2 en distintas regiones de nuestro pa\u00eds, el an\u00e1lisis a gran escala de secuencias, ensamblado de genomas, an\u00e1lisis filogen\u00e9ticos y filogeogr\u00e1ficos, epidemiolog\u00eda y evoluci\u00f3n molecular.<\/p>\n

EN AUMENTO<\/strong><\/p>\n

En esta segunda ola de coronavirus, el Laboratorio Central ubicado en esta capital recibe un promedio diario de 700 u 800 muestras, que arrojan una positividad promedio del 50 %. “Es un momento \u00e1lgido”, reconoce su director Carlos Pastor al definir la etapa actual de la pandemia; “no podemos decir que es el peor momento porque todav\u00eda no lo sabemos, Pero s\u00ed lo es comparado con el a\u00f1o pasado, tanto por el n\u00famero de muestras que se reciben como por la positividad y las camas ocupadas en los hospitales”, dato que se actualiza todos los d\u00edas y siempre va en aumento.<\/p>\n

Variantes de Sars-Cov-2 en las Am\u00e9ricas<\/strong><\/p>\n

Desde la caracterizaci\u00f3n gen\u00f3mica inicial del SARS-CoV-2, el virus ha evolucionado en diferentes grupos gen\u00e9ticos. La ocurrencia de mutaciones es un evento natural y esperado dentro del proceso de evoluci\u00f3n del virus.<\/p>\n

Mutaci\u00f3n se refiere a cualquier cambio en el genoma del virus.<\/p>\n

Algunas mutaciones espec\u00edficas definen los grupos gen\u00e9ticos virales que circulan actualmente en todo el mundo.<\/p>\n

En general, un virus mutado se considera variante del virus original.<\/p>\n

Existen diferentes tipos de mutaciones. Las variantes pueden diferir en una o m\u00e1s de ellas.<\/p>\n

Aunque la mayoria de mutaciones no tiene ning\u00fan impacto, algunas pueden resultar en que el virus sea m\u00e1s transmisible, o facilitar que el virus se escape de la respuesta inmune.<\/p>\n

En la comunidad, cuanto mas elevado es el nivel de transmisi\u00f3n, mayor es la probabilidad de que ocurran mutaciones en el virus. Fuente: Organizaci\u00f3n Panamericana de la Salud<\/p>\n

Fuente: Nancy Balza – El Litoral<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

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